創(chuàng)新進(jìn)展|單進(jìn)軍、謝彤團(tuán)隊(duì)構(gòu)建模擬譜庫(kù)快速表征一類特殊復(fù)雜脂質(zhì)——心磷脂及其氧化產(chǎn)物
近日,南京中醫(yī)藥大學(xué)單進(jìn)軍、謝彤團(tuán)隊(duì)在Analytica Chimica Acta(分析化學(xué)一區(qū),IF: 6.558)正式發(fā)表了題為In-silico-library-based method enables rapid and comprehensive annotation of cardiolipins and cardiolipin oxidation products using high resolution tandem mass spectrometer的研究性論文。
該文章基于Orbitrap高分辨質(zhì)譜平臺(tái),創(chuàng)新性的通過(guò)計(jì)算機(jī)模擬方式,建立了心磷脂及其氧化產(chǎn)物的質(zhì)譜譜庫(kù)。憑借高分辨質(zhì)譜平臺(tái)的超高分辨率、亞ppm級(jí)質(zhì)量精度,及Stepped NCE 高能碎裂模式(HCD)獲得的豐富二級(jí)碎片信息,使得該方法獲得模擬譜圖與真實(shí)檢測(cè)樣本的譜圖匹配一致性高。該創(chuàng)新分析方法的建立,對(duì)于解決以心磷脂及其氧化物為代表的、具有結(jié)構(gòu)多樣性及低豐度分析挑戰(zhàn)的代謝物/脂質(zhì),進(jìn)而研究其在疾病發(fā)生發(fā)展過(guò)程中的生物學(xué)效應(yīng),都有著廣泛而深遠(yuǎn)的參考與借鑒價(jià)值,為探索全新的疾病生物標(biāo)志物帶來(lái)可能!
文章賞析
心磷脂(CL)是含有3-4個(gè)脂肪?;鶄?cè)鏈的*磷脂。在真核生物中,它主要分布在線粒體內(nèi)膜,占線粒體內(nèi)膜磷脂總量的10-25%。心磷脂*的錐狀結(jié)構(gòu)能穩(wěn)定線粒體膜結(jié)構(gòu),參與維持線粒體正常的嵴形態(tài)。大量文獻(xiàn)報(bào)道心磷脂參與細(xì)胞色素c、電子呼吸鏈蛋白的正常功能。異常的心磷脂含量、結(jié)構(gòu)和心磷脂氧化會(huì)促使細(xì)胞凋亡并觸發(fā)免疫炎癥反應(yīng)。
在非靶向脂質(zhì)組學(xué)研究中,發(fā)現(xiàn)并快速注釋心磷脂及其氧化產(chǎn)物有助于探索心磷脂代謝在疾病發(fā)生發(fā)展過(guò)程中的生物學(xué)效應(yīng)。然而,由于心磷脂及其氧化物的結(jié)構(gòu)多樣性及低豐度特征,給其分析鑒定帶來(lái)極大的挑戰(zhàn)。為了解決這一問(wèn)題,團(tuán)隊(duì)在色譜和質(zhì)譜條件優(yōu)化的基礎(chǔ)上,基于計(jì)算機(jī)模擬方法建立了心磷脂及其氧化產(chǎn)物的質(zhì)譜譜庫(kù)。譜庫(kù)中涵蓋了31578個(gè)單溶血心磷脂、52160個(gè)心磷脂以及42180個(gè)氧化型心磷脂的質(zhì)譜譜圖(譜圖數(shù)據(jù)基于Q-Exactive-MS/MS質(zhì)譜方法裂解模擬)。
該模擬譜庫(kù)具有較好的兼容性,且譜庫(kù)中的模擬譜圖與真實(shí)檢測(cè)樣本的譜圖匹配度好,匹配度得分值高,并成功地運(yùn)用于線粒體非靶向心磷脂表征以及人工氧化心磷脂的研究中。
該研究列出了樣品與模擬譜庫(kù)的匹配結(jié)果,并附上了譜圖相似性評(píng)分(所有模擬譜庫(kù)的二級(jí)碎片和豐度均來(lái)源于標(biāo)準(zhǔn)品模擬)。在優(yōu)化的色譜條件下,模擬譜庫(kù)涵蓋了三個(gè)常規(guī)前體離子[M-2H]2-、[M-H]-和[M+NH4]+的二級(jí)譜圖,擴(kuò)充了質(zhì)譜譜庫(kù)中心磷脂特異性譜圖的數(shù)量。三種前體離子的模擬譜庫(kù)譜圖相似性評(píng)分較高,均表現(xiàn)出較好的匹配度,體現(xiàn)了該方法的優(yōu)勢(shì)。
運(yùn)用此方法,該研究對(duì)心、肝、脾、肺、腎、大腦、小腦、回腸、結(jié)腸、十二指腸以及Hep2、A549兩種細(xì)胞系中的心磷脂進(jìn)行了定性定量分析。為了評(píng)估匹配結(jié)果、驗(yàn)證該數(shù)據(jù)庫(kù)的可靠性,對(duì)不同譜圖相似性得分段的譜圖數(shù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì),結(jié)果顯示譜圖得分值均較高。在10種動(dòng)物組織線粒體和細(xì)胞系樣品中,一共鑒定出392種心磷脂。通過(guò)新建的計(jì)算機(jī)模擬心磷脂譜庫(kù),能夠很好的區(qū)分樣本中單溶血心磷脂和心磷脂,實(shí)現(xiàn)對(duì)復(fù)雜生物樣本中心磷脂的準(zhǔn)確測(cè)量。
該研究還建立了心磷脂氧化產(chǎn)物的模擬譜庫(kù),并成功對(duì)小鼠心臟和肝臟線粒體中的氧化型心磷脂進(jìn)行了歸屬。比較了兩種人工氧化方式氧化產(chǎn)物的偏好,發(fā)現(xiàn)Fenton反應(yīng)易于生成+O或者+2O的氧化產(chǎn)物,而過(guò)氧化叔丁醇的氧化反應(yīng)傾向于產(chǎn)生+3O或者+4O的氧化產(chǎn)物。通過(guò)對(duì)氧化碎片個(gè)數(shù)的統(tǒng)計(jì),發(fā)現(xiàn)占比最多的氧化碎片是C18-OH和C18-OOH,提示含有十八個(gè)碳的脂肪?;妆谎趸S腥さ氖?,在過(guò)氧化叔丁醇的反應(yīng)中,肝臟線粒體中的心磷脂似乎表現(xiàn)出更高的氧化產(chǎn)率,雖然沒(méi)有進(jìn)一步的驗(yàn)證,但是推測(cè)這種氧化效率的差異可能源于肝臟和心臟不同的代謝能力。
團(tuán)隊(duì)介紹
單進(jìn)軍,博士,教授
南京中醫(yī)藥大學(xué)中醫(yī)兒科學(xué)研究所副所長(zhǎng),江蘇省兒童呼吸疾?。ㄖ嗅t(yī)藥)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室副主任,南京中醫(yī)藥大學(xué)——UC Davis醫(yī)學(xué)代謝組學(xué)聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室中方負(fù)責(zé)人。江蘇省“333高層次人才培養(yǎng)工程”中青年學(xué)術(shù)技術(shù)帶頭人,江蘇省“六大人才高峰”高層次人才選拔培養(yǎng)對(duì)象,NIH West Coast Metabolomics Center訪問(wèn)學(xué)者。
研究方向:代謝組學(xué)與中醫(yī)藥;復(fù)雜疾病代謝調(diào)控機(jī)理及中藥防治作用。先后主持國(guó)家自然科學(xué)基金、江蘇省自然科學(xué)基金、江蘇省“333”工程科研項(xiàng)目和江蘇省高校自然科學(xué)研究重大項(xiàng)目等課題;以第一或(共同)通訊作者在Gut Microbes,Pharmacol Res,Anal Chim Acta,Phytomedicine和藥學(xué)學(xué)報(bào)等國(guó)內(nèi)外期刊發(fā)表學(xué)術(shù)論文60余篇;獲國(guó)家發(fā)明3項(xiàng);獲教育部科學(xué)技術(shù)進(jìn)步二等獎(jiǎng)、世界中聯(lián)中醫(yī)藥國(guó)際貢獻(xiàn)獎(jiǎng)-科技進(jìn)步二等獎(jiǎng)和江蘇中醫(yī)藥科學(xué)技術(shù)獎(jiǎng)一、二等獎(jiǎng)。
現(xiàn)為世界中聯(lián)兒童醫(yī)藥健康產(chǎn)品產(chǎn)業(yè)分會(huì)常務(wù)理事兼副秘書長(zhǎng)、世界中聯(lián)兒科專業(yè)委員會(huì)常務(wù)理事、中華中醫(yī)藥學(xué)會(huì)中藥實(shí)驗(yàn)藥理分會(huì)青年委員, 中國(guó)中醫(yī)藥信息研究會(huì)兒科分會(huì)理事、中國(guó)研究型醫(yī)院學(xué)會(huì)兒科學(xué)專業(yè)委員會(huì)青年委員,《世界科學(xué)技術(shù)-中醫(yī)藥現(xiàn)代化》雜志中青年編委。
謝彤,博士,副教授
江蘇省兒童呼吸疾?。ㄖ嗅t(yī)藥)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室骨干成員。2012年畢業(yè)于中國(guó)藥科大學(xué)藥學(xué)(藥物代謝動(dòng)力學(xué))專業(yè)。美國(guó)NIH West Coast Metabolomics Center (UC Davis)訪問(wèn)學(xué)者。近年來(lái)主持國(guó)家自然科學(xué)基金等廳局級(jí)以上課題研究8項(xiàng);以第一作者或者通訊作者在Anal Chim Acta,J Chromatogr A等雜志發(fā)表SCI論文10篇?,F(xiàn)為世界中醫(yī)藥學(xué)會(huì)聯(lián)合會(huì)兒科專業(yè)委員會(huì)理事。
研究方向:運(yùn)用代謝組學(xué)/脂質(zhì)組學(xué)技術(shù)研究(1)呼吸疾病發(fā)病機(jī)制及中藥干預(yù)作用;(2)中藥復(fù)雜組分的體內(nèi)外物質(zhì)基礎(chǔ)研究;(3)藥物安全性。
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