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基于賽默飛 Orbitrap GC-MS的非靶向代謝組學(xué)

2020年07月17日 10:36 來(lái)源:賽默飛色譜及質(zhì)譜

引言:代謝組學(xué)旨在表征和定量生物系統(tǒng)中的完整小分子代謝通路或 代謝物組。代謝物組包含小分子多元混合物(包括氨基酸、糖 和磷酸糖、生物胺和脂質(zhì))。非靶向代謝組學(xué)挑戰(zhàn)性,因 為其要求定性和定量上百個(gè)不同種類化合物,而有關(guān)這些代謝 物的經(jīng)驗(yàn)知識(shí)有限。因此,有必要使用一個(gè)既可以以非靶向的 方式靈敏檢測(cè)特定分子,又可以提供質(zhì)量數(shù)信息,用于確 認(rèn)未知物并對(duì)其進(jìn)行結(jié)構(gòu)解析的檢測(cè)系統(tǒng)。

 

氣相色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀(GC-MS)基于其自身的優(yōu)點(diǎn)經(jīng)常用于 代謝組學(xué)分析,尤其是其色譜分辨率、重現(xiàn)性、峰容量和便于 使用的質(zhì)譜庫(kù)。GC為非靶向代謝組學(xué)中生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)提 供了的色譜分離能力,但是,由于目前缺乏質(zhì)譜儀的 支持,從而限制了提供用于分析復(fù)雜樣品(例如,哺乳動(dòng)物的 肌肉組織)的動(dòng)態(tài)范圍、質(zhì)量數(shù)和掃描速度。鑒于大部分 重要代謝物的極性特征,必須將其衍生化,以使其有效揮發(fā), 從而確保得到良好的色譜分離。代謝組學(xué)分析尤其是臨床代謝 組學(xué)要求高通量和先進(jìn)的自動(dòng)化技術(shù)。

 

本項(xiàng)研究展示了新型 Thermo Scientific™ Orbitrap™ GC-MS 完整非靶向代謝組學(xué)工作流程,檢測(cè)了大鼠模型中的生物標(biāo)記 物,以判定其死亡時(shí)間。死亡時(shí)間(PMI)推斷是法醫(yī)調(diào)查中 一項(xiàng)關(guān)鍵也是困難的任務(wù),尤其當(dāng)尸體溫度與周圍環(huán)境溫 度達(dá)到平衡后。由于當(dāng)前用于確定 PMI 的方法不精que性且以 目視檢查尸體為主。因此,建立一種實(shí)驗(yàn)方法,使用耐用生物 標(biāo)志物推斷死亡時(shí)間可輔助法醫(yī)調(diào)查。

 

該 GC-MS 裝置使用基于 Orbitrap 的檢測(cè)器,得到超高質(zhì)量數(shù)分辨率、亞 ppm 質(zhì)量數(shù)精度、寬動(dòng)態(tài)范圍以及一定的掃描 速度,用于有效定量極復(fù)雜代謝組學(xué)樣品。高分辨率、穩(wěn)定的 質(zhì)量數(shù)精度和快速的掃描速度是進(jìn)行穩(wěn)定的數(shù)據(jù)解卷積的關(guān) 鍵因素,以檢測(cè)重疊 TIC 峰中的化合物,進(jìn)行非靶向代謝組 學(xué)分析。電子轟擊電離(EI)裂解模式也適合基于應(yīng)用廣泛的 NIST 庫(kù)和 Wiley 庫(kù)進(jìn)行匹配,以識(shí)別化合物,同時(shí)為更深入的 表征提供質(zhì)量數(shù)。

 

儀器和方法設(shè)置: 樣品制備 從各個(gè)大鼠腿部肌肉組織切片取樣,以時(shí)間順序增加進(jìn)行尸檢 及采樣。采用氯f(wàn)ang/甲醇/水(1:3:1)提取經(jīng)勻質(zhì)的組織切片中 的代謝物,在冰塊下孵育 1 小時(shí)。蛋白質(zhì)和 DNA 進(jìn)行離心沉 淀。去除上清液,貯藏在 -80 ℃ 條件下備用。

 

詳細(xì)文檔請(qǐng)點(diǎn)擊:GC-MS

 

關(guān)鍵詞: 氣質(zhì)聯(lián)用

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